Zbirka inkanabula sadrži 79 prvotisaka. Najstarija je Cezarov De bello Gallico tiskana u Rimu 1469. godine. Poznati engleski arheolog Sir Arthur Evans je 1932. godine tijekom boravka u Dubrovniku, nakon što je obavio istraživanja u okolici, poklonio inkunabulu De natura angelica (Firenca, 1499.) gradu Dubrovniku i njegovoj Knjižnici. To je ujedno i najvrjednija inkunabula koju Knjižnica posjeduje, a djelo je Jurja Dragišića, franjevca iz Srebrenice u Bosni, napisana u Dubrovniku za vrijeme njegova izbjeglištva iz Bosne. Dragišić je svoje djelo posvetio Senatu Dubrovačke Republike. Sir Arthur Evans je napisao sljedeću posvetu: »Ovu knjigu je darovao kao povijesnu uspomenu gradu Dubrovniku i njegovoj Gradskoj knjižnici Sir Arthur Evans koji je ovdje, kao i njezin autor, prvi put došavši kroz Bosnu, našao gostoljubljivo utočište (1875-1882). Prilikom njegovog ponovnog posjeta Dubrovniku nakon pedeset godina 18. lipnja 1932.